Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDC20Q12834 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDC20Q12834 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDC20Q12834 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDC20Q12834 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDC20Q12834 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC20Q12834 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC20Q12834 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC20Q12834 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC20Q12834 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC20Q12834 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC20Q12834 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms