Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BPTFQ12830 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms