Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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