Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms