Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR3Q06889 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms