Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBQ06643 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBQ06643 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBQ06643 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBQ06643 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBQ06643 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBQ06643 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBQ06643 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBQ06643 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBQ06643 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBQ06643 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBQ06643 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBQ06643 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBQ06643 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBQ06643 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBQ06643 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBQ06643 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBQ06643 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBQ06643 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBQ06643 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBQ06643 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBQ06643 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBQ06643 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBQ06643 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LTBQ06643 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBQ06643 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBQ06643 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBQ06643 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBQ06643 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBQ06643 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBQ06643 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBQ06643 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBQ06643 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBQ06643 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBQ06643 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBQ06643 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBQ06643 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBQ06643 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBQ06643 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBQ06643 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBQ06643 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBQ06643 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBQ06643 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBQ06643 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBQ06643 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBQ06643 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBQ06643 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBQ06643 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBQ06643 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBQ06643 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBQ06643 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBQ06643 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBQ06643 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBQ06643 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBQ06643 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBQ06643 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBQ06643 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBQ06643 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBQ06643 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBQ06643 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBQ06643 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBQ06643 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBQ06643 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBQ06643 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBQ06643 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBQ06643 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBQ06643 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBQ06643 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBQ06643 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBQ06643 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBQ06643 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms