Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms