Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms