Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms