Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms