Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB1P62873 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB1P62873 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB1P62873 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB1P62873 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB1P62873 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB1P62873 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB1P62873 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB1P62873 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB1P62873 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB1P62873 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB1P62873 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB1P62873 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB1P62873 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB1P62873 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB1P62873 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB1P62873 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB1P62873 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB1P62873 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB1P62873 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB1P62873 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB1P62873 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB1P62873 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB1P62873 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB1P62873 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB1P62873 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB1P62873 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB1P62873 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB1P62873 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB1P62873 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB1P62873 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB1P62873 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB1P62873 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms