Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL23P62829 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL23P62829 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL23P62829 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL23P62829 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL23P62829 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL23P62829 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL23P62829 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL23P62829 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL23P62829 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL23P62829 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL23P62829 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL23P62829 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL23P62829 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL23P62829 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms