Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms