Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVS71-1P61550 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVS71-1P61550 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms