Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTBP60709 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTBP60709 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTBP60709 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTBP60709 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTBP60709 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTBP60709 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTBP60709 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTBP60709 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTBP60709 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTBP60709 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTBP60709 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTBP60709 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTBP60709 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTBP60709 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTBP60709 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTBP60709 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTBP60709 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTBP60709 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTBP60709 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTBP60709 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTBP60709 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTBP60709 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTBP60709 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTBP60709 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTBP60709 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTBP60709 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTBP60709 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTBP60709 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTBP60709 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTBP60709 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTBP60709 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTBP60709 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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