Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP1P56182 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP1P56182 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP1P56182 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP1P56182 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP1P56182 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP1P56182 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP1P56182 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP1P56182 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP1P56182 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP1P56182 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP1P56182 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP1P56182 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP1P56182 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP1P56182 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP1P56182 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP1P56182 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP1P56182 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP1P56182 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP1P56182 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP1P56182 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP1P56182 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP1P56182 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP1P56182 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP1P56182 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP1P56182 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP1P56182 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP1P56182 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP1P56182 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP1P56182 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP1P56182 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP1P56182 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP1P56182 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP1P56182 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP1P56182 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP1P56182 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP1P56182 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP1P56182 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP1P56182 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP1P56182 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP1P56182 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP1P56182 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP1P56182 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP1P56182 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP1P56182 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP1P56182 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP1P56182 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP1P56182 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP1P56182 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP1P56182 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP1P56182 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP1P56182 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP1P56182 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP1P56182 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP1P56182 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP1P56182 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP1P56182 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP1P56182 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP1P56182 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP1P56182 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP1P56182 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP1P56182 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP1P56182 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP1P56182 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP1P56182 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP1P56182 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP1P56182 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP1P56182 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP1P56182 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP1P56182 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP1P56182 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP1P56182 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms