Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX9P55771 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX9P55771 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX9P55771 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX9P55771 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX9P55771 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX9P55771 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX9P55771 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX9P55771 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX9P55771 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX9P55771 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX9P55771 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX9P55771 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX9P55771 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX9P55771 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX9P55771 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX9P55771 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX9P55771 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX9P55771 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX9P55771 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX9P55771 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX9P55771 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX9P55771 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX9P55771 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX9P55771 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX9P55771 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX9P55771 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX9P55771 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX9P55771 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX9P55771 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX9P55771 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX9P55771 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX9P55771 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX9P55771 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAX9P55771 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAX9P55771 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAX9P55771 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAX9P55771 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAX9P55771 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAX9P55771 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAX9P55771 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAX9P55771 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms