Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLTPP55058 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLTPP55058 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLTPP55058 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLTPP55058 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLTPP55058 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLTPP55058 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLTPP55058 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLTPP55058 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLTPP55058 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLTPP55058 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLTPP55058 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLTPP55058 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLTPP55058 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLTPP55058 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLTPP55058 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLTPP55058 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLTPP55058 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLTPP55058 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PLTPP55058 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLTPP55058 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PLTPP55058 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLTPP55058 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PLTPP55058 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PLTPP55058 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PLTPP55058 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PLTPP55058 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLTPP55058 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLTPP55058 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLTPP55058 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLTPP55058 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLTPP55058 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLTPP55058 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLTPP55058 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLTPP55058 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLTPP55058 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLTPP55058 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLTPP55058 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLTPP55058 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLTPP55058 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLTPP55058 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLTPP55058 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLTPP55058 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLTPP55058 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLTPP55058 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLTPP55058 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLTPP55058 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLTPP55058 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLTPP55058 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLTPP55058 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLTPP55058 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLTPP55058 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLTPP55058 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLTPP55058 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLTPP55058 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLTPP55058 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLTPP55058 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLTPP55058 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLTPP55058 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLTPP55058 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLTPP55058 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLTPP55058 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLTPP55058 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLTPP55058 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLTPP55058 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLTPP55058 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLTPP55058 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLTPP55058 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLTPP55058 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLTPP55058 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLTPP55058 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLTPP55058 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLTPP55058 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLTPP55058 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLTPP55058 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLTPP55058 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLTPP55058 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms