Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms