Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMTNP53814 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMTNP53814 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMTNP53814 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMTNP53814 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMTNP53814 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMTNP53814 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMTNP53814 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMTNP53814 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMTNP53814 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMTNP53814 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMTNP53814 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMTNP53814 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMTNP53814 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMTNP53814 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMTNP53814 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMTNP53814 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMTNP53814 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMTNP53814 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMTNP53814 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMTNP53814 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMTNP53814 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMTNP53814 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMTNP53814 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMTNP53814 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMTNP53814 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMTNP53814 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMTNP53814 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMTNP53814 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMTNP53814 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMTNP53814 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMTNP53814 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMTNP53814 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMTNP53814 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMTNP53814 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMTNP53814 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMTNP53814 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMTNP53814 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMTNP53814 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMTNP53814 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMTNP53814 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMTNP53814 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMTNP53814 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMTNP53814 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMTNP53814 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMTNP53814 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMTNP53814 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMTNP53814 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMTNP53814 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMTNP53814 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMTNP53814 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMTNP53814 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMTNP53814 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMTNP53814 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMTNP53814 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMTNP53814 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMTNP53814 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMTNP53814 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMTNP53814 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMTNP53814 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMTNP53814 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMTNP53814 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMTNP53814 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMTNP53814 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMTNP53814 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMTNP53814 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMTNP53814 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMTNP53814 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMTNP53814 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMTNP53814 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMTNP53814 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMTNP53814 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMTNP53814 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMTNP53814 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMTNP53814 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMTNP53814 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMTNP53814 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMTNP53814 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMTNP53814 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMTNP53814 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMTNP53814 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMTNP53814 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMTNP53814 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMTNP53814 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMTNP53814 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMTNP53814 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMTNP53814 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMTNP53814 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMTNP53814 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMTNP53814 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMTNP53814 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMTNP53814 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMTNP53814 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMTNP53814 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMTNP53814 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMTNP53814 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMTNP53814 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMTNP53814 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMTNP53814 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMTNP53814 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms