Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBX1P52954 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBX1P52954 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBX1P52954 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBX1P52954 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBX1P52954 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBX1P52954 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBX1P52954 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBX1P52954 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBX1P52954 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBX1P52954 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBX1P52954 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBX1P52954 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBX1P52954 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBX1P52954 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBX1P52954 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBX1P52954 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBX1P52954 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBX1P52954 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBX1P52954 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBX1P52954 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBX1P52954 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBX1P52954 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBX1P52954 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LBX1P52954 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LBX1P52954 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LBX1P52954 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LBX1P52954 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LBX1P52954 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LBX1P52954 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LBX1P52954 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LBX1P52954 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LBX1P52954 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LBX1P52954 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LBX1P52954 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LBX1P52954 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LBX1P52954 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LBX1P52954 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LBX1P52954 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LBX1P52954 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LBX1P52954 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LBX1P52954 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LBX1P52954 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LBX1P52954 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LBX1P52954 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LBX1P52954 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LBX1P52954 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LBX1P52954 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LBX1P52954 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LBX1P52954 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LBX1P52954 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LBX1P52954 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LBX1P52954 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LBX1P52954 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LBX1P52954 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LBX1P52954 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LBX1P52954 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LBX1P52954 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LBX1P52954 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LBX1P52954 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LBX1P52954 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LBX1P52954 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LBX1P52954 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LBX1P52954 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LBX1P52954 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LBX1P52954 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LBX1P52954 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LBX1P52954 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LBX1P52954 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LBX1P52954 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LBX1P52954 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LBX1P52954 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LBX1P52954 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LBX1P52954 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LBX1P52954 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LBX1P52954 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LBX1P52954 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LBX1P52954 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LBX1P52954 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LBX1P52954 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LBX1P52954 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LBX1P52954 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LBX1P52954 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LBX1P52954 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LBX1P52954 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LBX1P52954 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LBX1P52954 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LBX1P52954 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LBX1P52954 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LBX1P52954 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LBX1P52954 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LBX1P52954 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LBX1P52954 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LBX1P52954 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LBX1P52954 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LBX1P52954 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LBX1P52954 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LBX1P52954 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LBX1P52954 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LBX1P52954 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms