Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR4P51571 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR4P51571 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR4P51571 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR4P51571 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR4P51571 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR4P51571 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR4P51571 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR4P51571 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR4P51571 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR4P51571 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR4P51571 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR4P51571 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR4P51571 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR4P51571 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR4P51571 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR4P51571 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR4P51571 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR4P51571 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR4P51571 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR4P51571 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR4P51571 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR4P51571 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR4P51571 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR4P51571 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR4P51571 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms