Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETV1P50549 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETV1P50549 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETV1P50549 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETV1P50549 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETV1P50549 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETV1P50549 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETV1P50549 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETV1P50549 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETV1P50549 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETV1P50549 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETV1P50549 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ETV1P50549 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ETV1P50549 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ETV1P50549 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETV1P50549 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETV1P50549 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETV1P50549 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETV1P50549 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETV1P50549 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETV1P50549 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETV1P50549 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETV1P50549 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETV1P50549 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETV1P50549 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ETV1P50549 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETV1P50549 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETV1P50549 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETV1P50549 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETV1P50549 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETV1P50549 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms