Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LHX1P48742 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LHX1P48742 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX1P48742 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX1P48742 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX1P48742 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX1P48742 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX1P48742 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX1P48742 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX1P48742 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX1P48742 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX1P48742 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX1P48742 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX1P48742 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX1P48742 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX1P48742 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX1P48742 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX1P48742 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX1P48742 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX1P48742 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX1P48742 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX1P48742 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX1P48742 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX1P48742 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX1P48742 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX1P48742 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX1P48742 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX1P48742 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX1P48742 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX1P48742 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX1P48742 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX1P48742 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX1P48742 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX1P48742 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX1P48742 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX1P48742 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX1P48742 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX1P48742 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX1P48742 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LHX1P48742 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LHX1P48742 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LHX1P48742 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LHX1P48742 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LHX1P48742 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LHX1P48742 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LHX1P48742 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LHX1P48742 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LHX1P48742 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LHX1P48742 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LHX1P48742 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX1P48742 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX1P48742 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX1P48742 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX1P48742 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX1P48742 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX1P48742 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX1P48742 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX1P48742 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX1P48742 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX1P48742 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX1P48742 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX1P48742 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX1P48742 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX1P48742 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX1P48742 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX1P48742 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX1P48742 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX1P48742 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX1P48742 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX1P48742 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX1P48742 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX1P48742 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX1P48742 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX1P48742 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX1P48742 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX1P48742 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX1P48742 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX1P48742 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX1P48742 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX1P48742 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX1P48742 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX1P48742 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX1P48742 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX1P48742 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX1P48742 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX1P48742 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX1P48742 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX1P48742 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX1P48742 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX1P48742 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX1P48742 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX1P48742 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX1P48742 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX1P48742 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX1P48742 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX1P48742 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX1P48742 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX1P48742 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX1P48742 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX1P48742 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms