Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME1P48163 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ME1P48163 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME1P48163 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME1P48163 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME1P48163 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME1P48163 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME1P48163 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME1P48163 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME1P48163 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME1P48163 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME1P48163 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME1P48163 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME1P48163 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME1P48163 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME1P48163 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME1P48163 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME1P48163 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME1P48163 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME1P48163 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME1P48163 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME1P48163 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME1P48163 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME1P48163 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME1P48163 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ME1P48163 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME1P48163 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME1P48163 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME1P48163 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME1P48163 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME1P48163 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME1P48163 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME1P48163 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME1P48163 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME1P48163 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME1P48163 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME1P48163 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME1P48163 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME1P48163 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME1P48163 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME1P48163 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME1P48163 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME1P48163 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME1P48163 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME1P48163 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME1P48163 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ME1P48163 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ME1P48163 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME1P48163 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME1P48163 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME1P48163 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms