Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms