Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCAMP43121 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCAMP43121 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCAMP43121 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCAMP43121 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCAMP43121 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCAMP43121 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCAMP43121 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCAMP43121 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCAMP43121 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MCAMP43121 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCAMP43121 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MCAMP43121 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCAMP43121 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCAMP43121 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCAMP43121 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCAMP43121 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCAMP43121 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCAMP43121 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCAMP43121 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCAMP43121 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCAMP43121 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCAMP43121 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCAMP43121 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCAMP43121 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCAMP43121 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCAMP43121 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCAMP43121 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCAMP43121 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCAMP43121 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCAMP43121 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCAMP43121 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCAMP43121 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MCAMP43121 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCAMP43121 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCAMP43121 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCAMP43121 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCAMP43121 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCAMP43121 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCAMP43121 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCAMP43121 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCAMP43121 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCAMP43121 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MCAMP43121 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCAMP43121 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCAMP43121 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCAMP43121 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCAMP43121 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCAMP43121 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCAMP43121 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCAMP43121 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCAMP43121 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCAMP43121 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCAMP43121 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCAMP43121 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCAMP43121 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCAMP43121 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCAMP43121 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MCAMP43121 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCAMP43121 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCAMP43121 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCAMP43121 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCAMP43121 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCAMP43121 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCAMP43121 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MCAMP43121 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCAMP43121 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCAMP43121 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCAMP43121 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCAMP43121 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCAMP43121 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCAMP43121 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCAMP43121 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCAMP43121 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCAMP43121 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCAMP43121 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCAMP43121 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCAMP43121 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCAMP43121 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCAMP43121 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCAMP43121 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCAMP43121 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCAMP43121 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCAMP43121 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MCAMP43121 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCAMP43121 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCAMP43121 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MCAMP43121 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MCAMP43121 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCAMP43121 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCAMP43121 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCAMP43121 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCAMP43121 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCAMP43121 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCAMP43121 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCAMP43121 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCAMP43121 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCAMP43121 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCAMP43121 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MCAMP43121 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms