Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms