Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPHP41219 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPHP41219 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPHP41219 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPHP41219 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPHP41219 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPHP41219 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPHP41219 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPHP41219 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPHP41219 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPHP41219 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPHP41219 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPHP41219 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPHP41219 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPHP41219 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPHP41219 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPHP41219 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPHP41219 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPHP41219 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPHP41219 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPHP41219 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPHP41219 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPHP41219 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPHP41219 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPHP41219 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPHP41219 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPHP41219 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPHP41219 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPHP41219 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPHP41219 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPHP41219 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPHP41219 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPHP41219 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPHP41219 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPHP41219 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPHP41219 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPHP41219 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPHP41219 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPHP41219 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPHP41219 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPHP41219 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPHP41219 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPHP41219 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPHP41219 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPHP41219 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPHP41219 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPHP41219 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPHP41219 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPHP41219 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPHP41219 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPHP41219 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPHP41219 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPHP41219 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPHP41219 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPHP41219 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPHP41219 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPHP41219 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPHP41219 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPHP41219 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPHP41219 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPHP41219 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPHP41219 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPHP41219 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPHP41219 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPHP41219 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPHP41219 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPHP41219 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPHP41219 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPHP41219 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPHP41219 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPHP41219 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPHP41219 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPHP41219 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPHP41219 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPHP41219 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPHP41219 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPHP41219 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPHP41219 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPHP41219 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPHP41219 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPHP41219 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPHP41219 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPHP41219 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPHP41219 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRPHP41219 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPHP41219 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPHP41219 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPHP41219 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPHP41219 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPHP41219 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPHP41219 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPHP41219 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPHP41219 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPHP41219 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPHP41219 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPHP41219 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPHP41219 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPHP41219 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPHP41219 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPHP41219 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms