Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms