Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RPL9P32969 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL9P32969 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL9P32969 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL9P32969 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL9P32969 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RPL9P32969 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL9P32969 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RPL9P32969 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL9P32969 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL9P32969 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL9P32969 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL9P32969 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL9P32969 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL9P32969 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL9P32969 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL9P32969 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL9P32969 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL9P32969 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL9P32969 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL9P32969 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL9P32969 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL9P32969 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL9P32969 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL9P32969 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL9P32969 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL9P32969 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL9P32969 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL9P32969 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL9P32969 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL9P32969 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL9P32969 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL9P32969 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL9P32969 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL9P32969 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL9P32969 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL9P32969 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL9P32969 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL9P32969 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL9P32969 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL9P32969 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL9P32969 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL9P32969 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL9P32969 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL9P32969 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL9P32969 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL9P32969 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL9P32969 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL9P32969 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL9P32969 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL9P32969 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL9P32969 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL9P32969 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL9P32969 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL9P32969 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL9P32969 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL9P32969 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL9P32969 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL9P32969 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL9P32969 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL9P32969 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL9P32969 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL9P32969 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL9P32969 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL9P32969 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL9P32969 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL9P32969 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL9P32969 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL9P32969 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL9P32969 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL9P32969 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL9P32969 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL9P32969 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL9P32969 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL9P32969 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL9P32969 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms