Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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TSPOP30536 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPOP30536 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPOP30536 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSPOP30536 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSPOP30536 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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TSPOP30536 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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TSPOP30536 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSPOP30536 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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TSPOP30536 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSPOP30536 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSPOP30536 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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TSPOP30536 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TSPOP30536 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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TSPOP30536 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TSPOP30536 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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TSPOP30536 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSPOP30536 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSPOP30536 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSPOP30536 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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TSPOP30536 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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TSPOP30536 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPOP30536 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TSPOP30536 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPOP30536 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TSPOP30536 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPOP30536 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPOP30536 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPOP30536 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPOP30536 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPOP30536 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TSPOP30536 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPOP30536 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPOP30536 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPOP30536 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TSPOP30536 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSPOP30536 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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