Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA5P30532 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms