Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMPK1P30085 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms