Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB9P28065 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms