Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCNE1P24864 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNE1P24864 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms