Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms