Protein–RNA interactions for Protein: P22897

MRC1, Macrophage mannose receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRC1P22897 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRC1P22897 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRC1P22897 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MRC1P22897 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRC1P22897 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRC1P22897 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRC1P22897 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRC1P22897 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MRC1P22897 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRC1P22897 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRC1P22897 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRC1P22897 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRC1P22897 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MRC1P22897 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRC1P22897 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRC1P22897 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRC1P22897 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRC1P22897 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRC1P22897 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRC1P22897 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRC1P22897 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRC1P22897 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MRC1P22897 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MRC1P22897 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRC1P22897 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRC1P22897 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRC1P22897 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRC1P22897 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRC1P22897 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MRC1P22897 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRC1P22897 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRC1P22897 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRC1P22897 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRC1P22897 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRC1P22897 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRC1P22897 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRC1P22897 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRC1P22897 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRC1P22897 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRC1P22897 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRC1P22897 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRC1P22897 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRC1P22897 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRC1P22897 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRC1P22897 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRC1P22897 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRC1P22897 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRC1P22897 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRC1P22897 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRC1P22897 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRC1P22897 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRC1P22897 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRC1P22897 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRC1P22897 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MRC1P22897 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRC1P22897 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRC1P22897 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRC1P22897 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRC1P22897 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRC1P22897 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRC1P22897 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRC1P22897 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRC1P22897 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRC1P22897 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRC1P22897 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRC1P22897 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRC1P22897 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRC1P22897 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRC1P22897 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRC1P22897 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRC1P22897 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MRC1P22897 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRC1P22897 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRC1P22897 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRC1P22897 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRC1P22897 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRC1P22897 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRC1P22897 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRC1P22897 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRC1P22897 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRC1P22897 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRC1P22897 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRC1P22897 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRC1P22897 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRC1P22897 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRC1P22897 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRC1P22897 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRC1P22897 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRC1P22897 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRC1P22897 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRC1P22897 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRC1P22897 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MRC1P22897 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRC1P22897 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRC1P22897 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRC1P22897 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRC1P22897 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRC1P22897 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRC1P22897 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRC1P22897 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms