Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms