Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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