Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA2P17301 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms