Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA1P15085 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA1P15085 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA1P15085 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA1P15085 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA1P15085 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA1P15085 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA1P15085 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA1P15085 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA1P15085 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA1P15085 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA1P15085 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA1P15085 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA1P15085 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA1P15085 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA1P15085 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA1P15085 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA1P15085 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA1P15085 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA1P15085 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA1P15085 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA1P15085 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA1P15085 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA1P15085 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA1P15085 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA1P15085 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA1P15085 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA1P15085 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA1P15085 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA1P15085 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA1P15085 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA1P15085 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA1P15085 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA1P15085 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA1P15085 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA1P15085 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA1P15085 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA1P15085 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA1P15085 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA1P15085 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA1P15085 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA1P15085 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA1P15085 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA1P15085 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA1P15085 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA1P15085 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA1P15085 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA1P15085 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA1P15085 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA1P15085 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA1P15085 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA1P15085 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA1P15085 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA1P15085 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA1P15085 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA1P15085 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA1P15085 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA1P15085 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA1P15085 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA1P15085 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA1P15085 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA1P15085 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA1P15085 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA1P15085 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA1P15085 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA1P15085 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA1P15085 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA1P15085 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA1P15085 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA1P15085 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA1P15085 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA1P15085 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA1P15085 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA1P15085 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA1P15085 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA1P15085 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA1P15085 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA1P15085 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA1P15085 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA1P15085 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA1P15085 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA1P15085 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA1P15085 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA1P15085 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA1P15085 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA1P15085 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA1P15085 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA1P15085 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA1P15085 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA1P15085 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA1P15085 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA1P15085 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA1P15085 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA1P15085 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA1P15085 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA1P15085 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA1P15085 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA1P15085 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA1P15085 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA1P15085 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms