Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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