Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYL1P12980 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LYL1P12980 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LYL1P12980 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LYL1P12980 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LYL1P12980 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYL1P12980 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYL1P12980 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYL1P12980 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYL1P12980 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYL1P12980 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYL1P12980 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYL1P12980 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYL1P12980 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYL1P12980 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYL1P12980 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYL1P12980 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LYL1P12980 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYL1P12980 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYL1P12980 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYL1P12980 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYL1P12980 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYL1P12980 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYL1P12980 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LYL1P12980 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYL1P12980 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms