Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms