Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODC1P11926 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODC1P11926 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODC1P11926 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODC1P11926 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODC1P11926 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODC1P11926 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODC1P11926 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODC1P11926 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ODC1P11926 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODC1P11926 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODC1P11926 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODC1P11926 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODC1P11926 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODC1P11926 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODC1P11926 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODC1P11926 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODC1P11926 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODC1P11926 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODC1P11926 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODC1P11926 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODC1P11926 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODC1P11926 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODC1P11926 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODC1P11926 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODC1P11926 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODC1P11926 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODC1P11926 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODC1P11926 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODC1P11926 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODC1P11926 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODC1P11926 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ODC1P11926 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODC1P11926 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODC1P11926 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODC1P11926 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODC1P11926 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODC1P11926 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODC1P11926 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODC1P11926 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODC1P11926 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODC1P11926 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODC1P11926 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODC1P11926 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODC1P11926 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ODC1P11926 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODC1P11926 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODC1P11926 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODC1P11926 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODC1P11926 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODC1P11926 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODC1P11926 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODC1P11926 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODC1P11926 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODC1P11926 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODC1P11926 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODC1P11926 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ODC1P11926 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODC1P11926 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODC1P11926 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODC1P11926 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODC1P11926 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ODC1P11926 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODC1P11926 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODC1P11926 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODC1P11926 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODC1P11926 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODC1P11926 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODC1P11926 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODC1P11926 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ODC1P11926 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ODC1P11926 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ODC1P11926 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ODC1P11926 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
ODC1P11926 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODC1P11926 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODC1P11926 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODC1P11926 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODC1P11926 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODC1P11926 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ODC1P11926 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODC1P11926 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODC1P11926 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODC1P11926 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ODC1P11926 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODC1P11926 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODC1P11926 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODC1P11926 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODC1P11926 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODC1P11926 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODC1P11926 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODC1P11926 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODC1P11926 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODC1P11926 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODC1P11926 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODC1P11926 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODC1P11926 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODC1P11926 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODC1P11926 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODC1P11926 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms