Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP2C9P11712 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP2C9P11712 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms