Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP10P09238 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP10P09238 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP10P09238 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP10P09238 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP10P09238 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP10P09238 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP10P09238 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP10P09238 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP10P09238 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP10P09238 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP10P09238 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP10P09238 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP10P09238 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP10P09238 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP10P09238 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP10P09238 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP10P09238 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP10P09238 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP10P09238 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP10P09238 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP10P09238 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MMP10P09238 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MMP10P09238 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP10P09238 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP10P09238 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP10P09238 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP10P09238 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP10P09238 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP10P09238 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP10P09238 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP10P09238 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP10P09238 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP10P09238 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP10P09238 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP10P09238 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP10P09238 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP10P09238 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP10P09238 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP10P09238 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP10P09238 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP10P09238 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP10P09238 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP10P09238 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP10P09238 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP10P09238 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP10P09238 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP10P09238 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP10P09238 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP10P09238 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP10P09238 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP10P09238 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP10P09238 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP10P09238 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP10P09238 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP10P09238 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP10P09238 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP10P09238 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP10P09238 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP10P09238 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP10P09238 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP10P09238 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP10P09238 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP10P09238 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP10P09238 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP10P09238 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP10P09238 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP10P09238 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP10P09238 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP10P09238 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP10P09238 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP10P09238 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP10P09238 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP10P09238 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP10P09238 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP10P09238 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP10P09238 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP10P09238 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP10P09238 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP10P09238 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP10P09238 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP10P09238 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP10P09238 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP10P09238 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP10P09238 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP10P09238 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP10P09238 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP10P09238 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP10P09238 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP10P09238 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP10P09238 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP10P09238 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP10P09238 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP10P09238 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP10P09238 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP10P09238 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP10P09238 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP10P09238 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP10P09238 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP10P09238 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms