Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP3A4P08684 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP3A4P08684 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP3A4P08684 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP3A4P08684 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP3A4P08684 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP3A4P08684 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP3A4P08684 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP3A4P08684 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP3A4P08684 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP3A4P08684 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP3A4P08684 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP3A4P08684 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP3A4P08684 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP3A4P08684 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CYP3A4P08684 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms