Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN3P07498 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN3P07498 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN3P07498 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN3P07498 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN3P07498 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN3P07498 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN3P07498 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN3P07498 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN3P07498 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN3P07498 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN3P07498 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN3P07498 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN3P07498 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN3P07498 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN3P07498 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN3P07498 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN3P07498 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN3P07498 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms